公元前200年至公元800年左右是馬雅文化最興盛的時期，是為古典期。馬雅人在這地區（主要以熱帶雨林為主）發展了數百座城市，提卡爾是其中最大的一個，學者估計在最高峰時，此城有10－20萬居民。他們發展成許多個農業密集的、城市集中的城邦。其中最為顯著的遺跡是建於宗教中心的金字塔，和伴隨它們的皇宮。其他重要的考古學遺跡還有雕刻石板（馬雅語：Tetun），這些用象形文字寫成的石板主要描述宗譜，戰爭勝利和其他的成就。帕倫克是古典期最美麗的馬雅城市，以至人們甚至將它譽為「美洲的雅典」。另外一座著名的城市叫做科潘，從現代遺蹟的規模來看可以把提卡爾、科潘和帕倫克視為馬雅文明古典時期最大的三個城邦。公元九世紀開始，中馬雅地區的城邦發生了嚴重的政治崩壞，大量的都市被遺棄，許多王朝都結束了，並轉往北部發展。到公元10世紀至11世紀末期，許多曾經繁榮的馬雅城市均被遺棄，並被叢林所覆蓋。

　　西元1523年末，西班牙征服者埃爾南·科爾特斯命其部將阿瓦拉多征服瑪雅城邦，並建立瓜地馬拉城，治理安地瓜，開始殖民瑪雅地區。西班牙人所帶來的天花和霍亂等外來疾病也在未來100年內使百分之九十的馬雅人死亡。而瑪雅人的反抗一直到最後的據點彼得盆地在1697年被西班牙攻陷為止，由瑪雅的部落首長帶領。