公元前700至900年間，普韋布洛人放棄在懸崖上挖掘坑洞的生活方式，並建造有很多房間的長方形大型建築，使用土坯、石頭等材料。 到公元1050年，他們發明了像大型堡壘一樣的階梯形建築群落，一個建築就是一個村鎮。 這些堡壘型的村落通常建在防禦性地區，可以抵禦北方阿帕奇人的襲擊，普韋布洛與阿帕奇族群長期處於戰爭狀態。

　　1540年，西班牙探險家弗朗西斯科·巴斯克斯·德·科罗纳多從科波斯特拉出發組織了有幾千人（包括歐洲人和中美洲部落盟友）向着普韋布洛聚居地進發探險。在1540年的冬天，他的軍隊與當地普韋布洛人發生衝突，導致了殘酷的蒂格斯戰爭（Tiguex War）。這場戰爭導致了蒂格斯普韋布洛人數白人死亡。隨後，西班牙人在該地區開始殖民。西班牙傳教士將普韋布洛人轉變為天主教徒，並建立了殖民地。

　　1680年，普韋布洛原住民爆發了史稱普韋布洛起義的反抗行動，這是美洲原住民首次成功的反抗西班牙殖民者；他們將西班牙殖民者從該地區驅逐了12年。總共有2500多名普韋布洛戰士參與了起義，殺死了400名西班牙人，並將其與2000殖民者趕出了該地區。不過12年後，西班牙人再次回來，德·瓦爾加斯帶領60名士兵和七門大砲，經過談判，雙方達成和平協議。不過，之後西班牙人在此地對原住民的壓迫越來越嚴格。1696年，14名原住民展示試圖進行第二次有組織的反抗，使用西班牙人的武器殺死了一些傳教士和居民，但後來被西班牙鎮壓。到17世紀末期，許多普韋布洛人往北方逃離到阿帕奇和納瓦霍地區，普韋布洛最後一個定居點被西班牙人發現，西班牙對普韋布洛村鎮的殖民基本完成。

　　普韋布洛人的強有力的武力反抗，雖然最終以失敗告終，獨立的時間相對是短暫的，但普韋布洛也保住了自己的文化免於被西班牙人消滅，西班牙人第二次返回時放棄了強行傳教。同時，在殖民時期，西班牙人向普韋布洛人發放土地補償，並任命了一名公共辯護人，以在法庭上保護原住民的權利。